建安五年四月四日（200年5月5日）[38] ，孙策在丹徒山中打猎。他骑的是一匹快马，扈从骑兵被远远的甩在后面。这时忽然碰到三个人，这三人都是被孙策所杀的吴郡太守许贡的门客，孙策问：“你们是什么人？”三人回答说：“我们是韩当的士兵，在这里射鹿。”孙策说：“韩当的士兵我全部认识，从没见过你们。”说完向其中一个射箭，那个人随着弓弦的声音而倒下。余下二人非常恐慌当即弯弓搭箭，向孙策射来。孙策面颊中箭。这时，后面的扈从骑兵寻找到孙策，将刺客全部杀死。[
孙策伤势甚重，自知不久于人世，就请来张昭等人，托以后事：“中原正在大乱之中，凭我们吴、越的兵众，三江的险固，足以观其虎斗成败。你们要好好辅佐我弟弟！”又对张昭说：“如果我弟弟孙权不能胜任，你就可以取而代之。即使不能胜利，慢慢西归，也没有什么顾虑了。”又招呼孙权，将印绶交予他，对他说：“率领江东兵众，决战两阵之间，横行争衡天下，你不如我；但举贤任能，使其各尽其心，用以保守江东，我不如你。”到夜间孙策便去世了，年仅二十六岁。[
孙权登基称帝后，追谥孙策为“长沙桓王”。[41] 为孙策立庙于建业朱雀桥南，[42] 后来派太子孙和前去亲祭。
主要影响
军事
击走刘繇
兴平二年（195年），孙策在周瑜、程普和黄盖等人的支持下，从历阳渡江，首先打败了牛渚营（今采石矶）的刘繇，夺得仓库中所有粮食和兵器战具。[43] 当时，彭城相薛礼、下邳（今江苏省睢宁县古邳镇）相笮融都依附刘繇，奉他为盟主，薛礼占据秣陵城（今江苏省南京市），而笮融驻扎在秣陵县南。孙策首先攻打笮融，斩杀五百多人，笮融害怕，紧闭营门，不敢妄动。[44]
孙策转而挥师攻打秣陵城（今江苏省南京市）的薛礼，薛礼突围逃走。这时樊能、于麋等人，又纠集兵士来夺牛渚。孙策立即回军，打败他们，俘获男女万馀人。然后再次进攻笮融。在与笮融的战斗中，孙策腿部中箭，无法乘马，部下抬他回营疗伤。[45] 在孙策受伤之时，曾经投降的“男女万馀人”趁机反叛，孙策的舅舅吴景率军攻讨反叛者，将反叛者们全部擒获。[46]
有的反叛者逃到笮融的营中，说：“孙策被箭射死了！”笮融听闻孙策的死讯，非常高兴，于是派遣军队重新进军，与孙策的部队进行对垒。孙策先派遣数百兵马挑战诱敌，又在后面埋伏好兵马。等到笮融的军队出击时，孙策的数百兵马假装溃败，将敌兵引入包围圈中，然后，孙策一声令下，伏兵尽起，斩杀敌军一千多人。孙策乘胜进攻笮融的营地，并命令将士们高声喊话：“孙郎究竟如何了？”喊声震撼敌营。不少敌兵听闻了孙策没死的消息，吓得连夜奔逃。笮融听闻了孙策没死的消息，越发恐惧，深沟高垒，严加守备。[
孙策见笮融负险固守，一时难以攻克，便引兵南向，先在梅陵（今安徽省南陵县）击败刘繇的别部，接着转兵攻克湖孰（今江苏省江宁县南湖熟镇）、江乘（今江苏省句容县）等地。然后整顿部队，到曲阿与刘繇决战。[
刘繇与孙策交战，遭到惨败，逃往丹徒（今江苏省镇江市），孙策入据曲阿（参见曲阿之战）。[49] 孙策大军所到之处，军士们严遵将令，不掳掠百姓，鸡犬菜茹，秋毫无犯。于是，百姓十分喜悦，争着用牛、酒犒劳部队。[50] 孙策慰劳赏赐将士，派遣部下陈宝到阜陵迎接母亲和弟弟。又发布文告，告知下属各县：“刘繇、笮融的乡人和部下来投降的，一概不多问其他；愿意从军的，可以从军，并免除全家赋税徭役；如果不愿从军，绝不勉强。”文告发布后，来归附者从四面八方赶来，不长时间，就招得士兵两万多，征得马匹一千多。自此，孙策之名威震江东。[51]
平定会稽
建安元年（196年），孙策继续进攻江东各地，吴郡人严白虎等各率有一万多人，驻扎严守各自的地盘。吴景等想先击破严白虎等，然后再到会稽。孙策说：“严白虎等群盗，心无大志，凭此就能将其擒获。”于是率兵渡过浙江，直逼会稽。[22] 会稽功曹虞翻劝太守王朗暂避孙策的锋芒，王朗不听，发在固陵（浙江省萧山县）阻击孙策。孙策几次发动进攻，均未能奏效。孙策的叔父孙静献策，建议声东击西，从查渎进兵，出其不意，攻其不备。孙策依计。于夜里一面到处点燃火把，迷惑、牵制正面之敌，一面分出兵马悄悄从查渎出击。王朗出于意外，大惊，派周昕率兵仓猝迎战，孙策斩杀周昕，长驱直入。王朗败溃，带虞翻乘船逃到东冶（今福建省福州市）。孙策派贺齐追击，王朗投降，于是会稽平定。
袭取庐江
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